Tholen heeft een relatief lage diversiteit aan dieren- en plantensoorten per vierkante kilometer in vergelijking met andere Zeeuwse gemeenten. Uit gegevens van Laudius blijkt dat Tholen slechts 22 verschillende soorten per vierkante kilometer heeft, terwijl het Zeeuwse gemiddelde op 40 soorten per vierkante kilometer ligt, wat 5% hoger is dan het nationale gemiddelde van 38 soorten per vierkante kilometer.
Schouwen-Duiveland wordt aangemerkt als de gemeente met de hoogste biodiversiteit in Zeeland, met 64 verschillende soorten per vierkante kilometer. Deze conclusies zijn gebaseerd op een analyse van 75 miljoen waarnemingen van de Global Biodiversity Information Facility.
In Zeeland worden veel vogels gezien, zoals de kleine mantelmeeuw, lepelaar en scholekster, ondanks dat meer dan 90 vogelsoorten in Nederland als bedreigd worden beschouwd. Sommige van deze bedreigde vogels worden nog steeds waargenomen in Zeeland, vooral in de gemeente Vlissingen.
Op het gebied van planten worden roodzwenkgras en akkerdistel vaak aangetroffen in Zeeland. Wat betreft paddenstoelen en schimmels is het groot dooiermos het meest opvallend, met 812 waarnemingen in de afgelopen 70 jaar.
De biodiversiteit varieert sterk tussen Zeeuwse gemeenten, waarbij Schouwen-Duiveland, Middelburg en Vlissingen bovenaan staan met respectievelijk 64, 54 en 54 soorten per vierkante kilometer, terwijl Kapelle en Tholen onderaan de lijst staan met slechts 15 en 22 soorten per vierkante kilometer.
